Je vais essayer ca.
Export de la base puis un import sur le nouveau site en gardant l'interclassement.
Si ca marche pas, je l'importe en changeant l'interclassement.

Pour info, mon fils à fait un petit test il y a 2 ans en créant un site avec kwsphp pour son stage de 3eme, et quand je le transfere, c'est le meme probleme (Interclassement aussi en latin1_swedish_ci)