C'est bizarre j'ai pas ce problème moi :/

Essaye de remettre la requête par défaut:

$sql2 = 'SELECT COUNT(`forum_topic`.`id`) AS news,`ref` FROM `forum_topic` WHERE (' . $cond . ') GROUP BY `ref` ORDER BY `ref`';

Mais c'est étrange, en tout cas "Une erreur s’est produite.
Vos sujets non lus ont été supprimés."

Rassures-toi ce ne sont pas les sujets en eux même qui ont été supprimé, mais ta lecture pour eux, en gros c'est comme si tu les avais lu, mais ils sont pas supprimé ^^